提取RNA的详细步骤
问题描述
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分子克隆技术(华农)实验一质粒的制备质粒是携带外源基因进入细菌中扩增或表达的主要载体,它在基因操作中具有重要作用。质粒的分离与提取是最常用、最基本的实验技术。质粒的提取方法很多,大多包括3个主要步骤:细菌的培养、细菌的收集和裂解、质粒DNA的分离和纯化。本实验以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。实验目的:掌握碱裂解法抽提质粒的原理、步骤及各试剂的作用。实验材料:含有质粒pUC18载体的大肠杆菌菌液,克隆有水稻外源片段的BAC的大肠杆菌菌液。 实验原理:在pH 12.0 ~ 12.6碱性环境中,细菌的线性大分子量染色体DNA变性分开,而共价闭环的质粒DNA虽然变性但仍处于拓扑缠绕状态。将pH调至中性并有高盐存在及低温的条件下,大部分染色体DNA、大分子量的RNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍然为可溶状态。通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。实验步骤:
1.取含有pUC18质粒的大肠杆菌菌液于LA培养基上37℃过夜培养;
2.用无菌牙签挑取单菌落,接种于含有Amp抗生素的LB培养基中,37℃摇床~250 r/min过夜培养;3.吸取1.5 ml菌液,12000 g离心2分钟,收集菌体,倒掉菌液;吸取1.5 ml菌液,再次收集菌体,尽量将菌液倒干净;4.加入300 ml溶液 I振荡打匀,重新悬浮细胞,震荡混匀(注意:应彻底打匀沉淀或碎块); (剧烈)
5.加入300 ml溶液II,轻柔颠倒混匀,放置至清亮,一般不超过5分钟;6.加入300 ml溶液III颠倒混匀,放置于冰上10分钟,使杂质充分沉淀;(温和)
7.12000 g离心10分钟;8.吸取800 ml上清液(注意:不要吸取到飘浮的杂质)至另一Eppendorf管中,加入2/3体积的异丙醇,室温下放置5分钟;9.12000 g 常温离心15分钟;
10. 倒尽上清,加75%乙醇浸洗除盐(放置片刻或离心3分钟后倒去上清);11. 室温放置或超净台上风干DNA;12. 加40 ml灭菌超纯水或TE溶解;13. 质粒、BAC的质量检测,于-20℃保存。附注:质粒检测电泳检测:质粒电泳一般有三条带,分别为质粒的超螺旋、开环、线型三种构型吸光值检测:采用分光光度计检测260nm、280nm波长吸光值,若吸光值260nm/280nm的比值介于1.7-1.9之间,说明质粒质量较好,1.8为最佳,低于1.8说明有蛋白质污染,大于1.8说明有RNA污染。实验二DNA的琼脂糖凝胶电泳带电荷的物质在电场中的趋向运动称为电泳。电泳的种类多,应用非常广泛,它已成为分子生物学技术中分离生物大分子的重要手段。琼脂糖凝胶电泳由于其操作简单、快速、灵敏等优点,已成为分离和鉴定核酸的常用方法。实验目的:掌握琼脂糖凝胶电泳的原理,学习琼脂糖凝胶电泳的操作。实验材料:质粒DNA、BAC、植物总DNA
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