sh质粒和sirna区别
问题描述
- 精选答案
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siRNA 是合成的,从公司买回来,可以直接用于短暂性的转染,用完就没有了。优点是快速便利。
shRNA 是基于质粒的。需要自己克隆,也有公司卖不过较自己克隆要贵得多。
因为是质粒,所以可以无限制的扩增,不会有用完的一天。
质粒的转染效率跟siRNA类似,不过shRNA被表达出来需要时间,所以效果可能没有siRNA直接快速。
但是shRNA质粒一般含有抗生素选择基因,这就允许你筛选稳定细胞系,不过这个很花时间(1-3个月)
不过一旦稳定细胞系筛选成功,你就再不用做转染实验了,一劳永逸。
所以两者各有所长,要看你的实验性质。
如果只是补个数据,果断用siRNA。如果建立起稳定细胞体系以后还有很多实验,建议用shRNA,
医学科研中易混淆的概念解释之siRNA篇:
1 siRNA和shRNA,虽然都是干扰RNA类型,但是siRNA和shRNA却有着天壤之别。siRNA是单链RNA干扰,通过结合mRNA,阻止蛋白的表达。shRNA其实是一类病毒,整合至基因组中进行基因干扰。因此siRNA和shRNA的最大区别就在于是否整合进入了基因组中以及转染有效性的长短。两者在转染效率上现在已经没有特定的差别。
2 通路阻断剂和siRNA之间的区别。有些实验会使用通路阻断剂,例如akt通路阻断剂
LY294002,有些老师也会使用siRNA来阻断Akt的激活。两者之间有什么区别?最大的区别在于阻断剂是影响蛋白的活性(例如乙酰化、磷酸化和泛素化激活等);而siRNA是直接降低蛋白的表达。因此,在细胞需要某些蛋白的时候,最佳的方式是使用阻断剂而不是用siRNA ,因为蛋白表达下降很可能会造成额外的阳性结果出现。
3 siRNA和非编码RNA。siRNA不属于非编码RNA类型,是属于和mRNA具有互补作用的RNA单链。而非编码RNA是细胞内没有基因编辑功能的RNA总称。siRNA可能会影响非编码RNA的稳定,而非编码RNA是无法通过siRNA进行抑制和下调的。
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