DNA跑完胶后为什么要进行纯化PCR后的DNA
问题描述
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谢邀。高保真的酶是不能够用来PCR后直接去连接TA克隆的,必须用TAQ加A尾纯化后才能连接.给你个做的方法,首先PCR扩增目的片段,可以配两个40ul的体系,PCR循环可以增加到35个循环,这样可以保证PCR产物量多,而且保真性也好。
然后跑胶,胶回收,胶回收溶解DNA的时候,尽量用比较大的体积的水溶解下来,这样可以保证尽可能量大的获得PCR产物,然后去加A尾,加A尾的时候,使用ATP和dATP都可以,但是ATP跟dATP不可浓度太高,太高浓度的dATP会抑制taq酶的活性,taq酶加的时候要控制在总体积的百分之十以内,加A尾一般是72度,30min.l,自己做的时候可以适当延长时间。
加A尾完成后,胶回收,尽量用少的水来溶解DNA,这个时候要保证DNA的浓度尽可能的高。
连接的时候,如果片段浓度高的话,片段又不太长,我习惯连1h,转化挑克隆基本效率能有百分之百,如果片段浓度低,长度又长,可以适当延长连接时间。
TA克隆载体大小相对来小,装载片段的长度是有限的,片段长度如果比载体还大,效率就会降低,这时候尽量要多PCR,延长连接时间,这样子可以提高效率的。
再补一段,鉴定的时候可以先把细菌挑到96孔板,细菌摇起来以后去PCR鉴定,Takara 的PMD19T里应该有说明书的,里面应该有设计好的引物。
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