pcr反应常用的缓冲液为
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PCR反应中缓冲液是一个重要的影响因素,特别是其中的Mg2+能影响反应的特异性和扩增片段的产率。目前最为常用的缓冲体系为l0~50mmol/L的Tris—HCl(pH8.2~8.3,20℃),PCR标准缓冲液含有10mmol/L的Tris—HCl(pH8.3)、50mmol/L的KCl、1.5mmol/L的Mg2+、0.1g/L的明胶。在一般的PCR反应中,1.5~2.0μmol/L Mg2+是比较合适的(对应dNTP浓度为200μmol/L左右)。Mg2+过量能增加非特异扩增并影响产率。
现在认为限制KCl和明胶的用量值得提倡,尤其是BSA,虽其对酶有一定保护性,如果质量不好将起相反的作用,建议使用乙酰化的BSA。KCl在50mmol/L时能促进引物退火,大于此浓度时将会抑制聚合酶的活性。有的反应液以氯化铵或醋酸铵中的NH+才代替K+,其浓度为16.6mmol/L。
在PCR中使用10~50mmol/L Tris HCl,主要靠其调节pH使Taq DNA聚合酶的作用环境维持偏碱性。Tris缓冲液是一种双极化离子缓冲液,pKa为8.3(20℃),△pKa为一0.021/℃。
在反应体系中加入适量(10%)的二甲基亚砜(DMSO),虽然DMSO对聚合酶活性有一定抑制作用,但它可减少模板二级结构,提高PCR反应特异性。有报道指出甲酰胺或氯化四甲基铵(TMAC)均可提高反应特异性,而对酶活性没有明显影响。
PCR标准缓冲液对大多数模板DNA及引物都是适用的,但对某一特定模板和引物的组合,标准缓冲液并不一定就是最佳条件,因此各实验室可在此条件上,根据具体扩增项目进行改进。其中Mg2+浓度对扩增作用的特异性和产量有明显影响。Taq酶是一种Mg2+依赖酶,Mg2+浓度一般为1.5mmol/L左右,Mg2+浓度过低时,酶活力明显降低;过高时,酶可催化非特异性扩增。由于反应体系中的DNA模板、引物和dNTP都可能与Mg2+结合,因此降低了Mg2+的实际浓度。所以建议反应中Mg2+用量至少要比dNTP浓度高O.5~1.0mmol/L。
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