电泳中为什么要使用电泳缓冲液和加样缓冲液

问题描述

精选答案

很好的问题。横向比较对于理解深层次的东西很有好处。

这个问题涉及到核酸与蛋白质性质的差异，还有电泳原理。

蛋白质电泳中加入SDS是为了去除本身电荷与分子形状的影响，核酸就不需要。ＤＮＡ分子形状一致，都是双螺旋。至于电荷，都是磷酸的电荷，所以电荷数量与分子量成正比，这与ＳＤＳ结合的蛋白质很相似，就是荷质比是一个常数，通过分子筛效应分离，分子越长，摩擦力越大，就落在后面。所以ＤＮＡ电泳不用额外加变性剂。

另外，核酸的变性剂与蛋白质也不同。核酸变性剂一般是打开双链，测序或ＲＮＡ电泳的时候才会加入，一般是甲醛或尿素，而不是ＳＤＳ。

ＳＤＳ与蛋白质结合是以其疏水尾插入蛋白质中，结合力是疏水键，是一种次级键，不是化学键，所以不是化学反应，可以看作很强的物理吸附。平均大约２个残基结合一个ＳＤＳ。

２０种氨基酸有３种碱性氨基酸，２种酸性氨基酸，它们可以电离，别的基本不电离。比如谷氨酸和天冬氨酸，侧链带羧基，电离情况与末端羧基近似，在中性条件下带负电。核酸中每一个磷酸都带负电，碱基不带电。