定点突变是怎么通过PCR作用达到目的的
问题描述
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定点突变是准备多个带突变的引物,退火后全部突变引物都结合在同一环状单链模版,PfuTurbo聚合酶延伸,碰到下一个引物就停止,各片断经连接成环,和单链模版组成杂和环,DpnI消化双链模版,也消化杂和环中的模版,只留下新合成的带多个突变的单链环,得以转化E.coli,形成双链质粒。
具体来讲是:设计一对包含突变位点的引物(正、反向),和模版质粒退火后用PfuTurbo聚合酶“循环延伸”,(所谓的循环延伸是指聚合酶按照模版延伸引物,一圈后回到引物5’端终止,再经过反复加热褪火延伸的循环,这个反应区别于滚环扩增)正反向引物的延伸产物退火后配对成为带缺刻的开环质粒。
DpnI酶切延伸产物,由于原来的模版质粒来源于常规大肠杆菌,是经dam甲基化修饰的,对DpnI敏感而被切碎(DpnI识别序列为甲基化的GATC,GATC在几乎各种质粒中都会出现,而且不止一次)、而体外合成的带突变序列的质粒由于没有甲基化而不被切开,因此在随后的转化中得以成功转化,即可得到突变质粒的克隆。扩展资料不同于定点突变的是基于PCR的随机突变,通过改变PCR条件提高PCR过程中的随机出错,这种方法适用于未知的蛋白质,作全局性分析,所以有人称为饱和突变(saturation mutagenesis)。
不过这种方法由于没有目的性,分析操作相当繁琐,并且不会出现一个位点2个以上碱基突变,因而应用上有局限性。
定点突变适用于蛋白结构已有初步了解的基因,比PCR随机突变更有目的性,也更为精确,简单。根据生物学理论知识,基因会发生突变,突变可以自发,也可以诱发。
但在加拿大生物化学家M·史密斯(1932-2000年)发明定点突变法之前,突变株的产生必须经由自然界或用化学等方法诱使基因体突变。
这类方法属于随机突变,突变株必须在生物形状上有所改变,才能确定有突变发生,但除非用分子生物方法或遗传方法找到此突变处,否则无法确定突变位置。
也就是说,这种突变是盲目的。
而史密斯发明的定点突变法却是有目的的,该法可经由设计好的寡核苷酸,在任何一个基因片段上进行随意或设计好的突变,也就是说,这种突变是预先设定好的,所以也有人将该法称为“反遗传法”。
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