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什么是上调基因和下调基因

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问题更新日期:2024-10-16 03:05:21

问题描述

什么是上调基因和下调基因求高手给解答
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我记得没错的话,基因的上调就是基因转录成mRNA时受到正向调控,促进表达。

基因的下调是受到抑制,表达量减少。这样没错吧?

然后,我猜想你遇到的问题应该是在做富集测试分析的时候,log2FC值和基因id进行分类后,得出的下调基因的表达要远高于上调基因的情况,于是提出了这个问题。

最后,是我的猜想和一点不成熟的想法。

1、组织取样是否是某些功能性组织,因此基因表达过程存在特异性?

2、抑制量高于表达量,是否是数据污染,抑或是你的取样存在差异性?

3、真核生物基因可有一个以一的poly(A)位点,因此能在不同的细胞中产生具有不同3’末端的前mRNA,从而会有不同的剪接方式。由于大多数真核生物基因的转录物是先加poly(A)尾巴,然后再行剪接,因此不同组织、细胞中会有不同的因子干预多聚腺苷酸化作用,最后影响剪接模式。是否由于该样本存在某些干预导致了某些部分的表达量异常,平均后导致数据整体异常

4、最后一点,当然不是怀疑你的努力和专业性,就会不会是标注的过程中,存在着些许的操作不当或者是别的原因,导致数据异常了呢?

其他回答

上调就是基因转录成mRNA时受到正向调控,促进表达。下调是受到抑制,表达量减少。

在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录(transcription)。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链(template strand)或反义链(antisense strand)。

而不作为转录模板的链称为编码链(coding strand)或有义链(sense strand),编码链与模板链互补,它与转录产物的差异仅在于DNA中的胸腺嘧啶(T)变为RNA中的尿嘧啶(U)。

在含许多基因的DNA双链中,每个基因的模板链并不总是在同一条链上,亦即可作为某些基因模板链的一条链,同时也可以是另外一些基因的编码链。