如何将基因组序列定位到染色体上

问题描述

精选答案

基因的染色体定位方法多种多样，它可分为基因的遗传作图和物理作图，而物理作图中最主要是荧光原位杂交（FISH）和放射杂交体（RH）二种。小弟提供目前主要的几种基因作图方法：荧光原位杂交（FISH），放射杂交体法（RH），脉冲场凝胶电泳（PFGE），Contig拼接(contig assembly)和染色体步移(chromosome walking)，基因定位克隆（positional cloning)，比较基因作图(comparative gene mapping)或比较物理图谱(comparative physical maps)

关于基因的染色体定位尚有不少其它的方法，其中OpGen公司的Whole Genome Mapping技术克服NGS短读支架（short read scaffold）的局限，生成长超级支架，完成装配达到接近染色体定位基因序列水平。目前国内好像有三台已经安装的机器，北京药值所有1台，天津生物芯片有1台，华大基因有1台。其中北京药值所的自己用，另外两家都承担对外服务项目。