如何鉴定一个已知rdna-its序列的菌种

问题描述

精选答案

ITS序列是指真菌rDNA上的5.8s，18s和28srDNA序列之间的转录间隔。

5.8s，18s和28srDNA序列进化上高度保守，而ITS序列由于选择压力小，在自然中变异较快，在绝大多数真菌中表现出序列多态性，表现为种内相对一致，种间差异比较明显，非常适合真菌鉴定以及系统发育分析。

由于ITS鉴定快速，分析准确，有效弥补了传统鉴定方法的不足，得到了广泛应用。

利用ITS序列分析可以实现对多数品种真菌的快速准确鉴定。

鉴定中无需反复培养进行生理生化反应和实验，极大缩短了鉴定周期和鉴定准确度。

鉴定步骤包括:* 提取微生物样品DNA* 扩增出真菌ITS区序列* DNA测序，将样品序列与GenBank中已知序列进行比对* 判定微生物种类，可将微生物划分到属或种* 与同源性较高菌种构建系统发育树