质粒跑电泳为什么会有三条带

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精选答案

质粒DNA分子具有三种构型：共价闭合环DNA（cccDNA,SC构型）、开环DNA（OC构型）和线性分子（L构型）。在细菌体内，质粒DNA是以负超螺旋构型存在的。在琼脂糖凝胶电泳中不同构型的的同一种质粒DNA,尽管分子量相同，但具有不同的电泳迁移率。其中跑在最前沿的是共价闭合DNA，其后依次是线性DNA和开环DNA,其原因是共价闭合的DNA其空间位阻最小，所以跑得最快。而开环DNA空间位阻最大，所以跑得最慢。不过并不是每次提取的质粒都有三条带，两条带的情况也很多见，如你的空质粒。