如何确认gwas中的SNP哪些是tagSNP

问题描述

精选答案

功能snp一般指对相应基因表达蛋白活性或表达量有明显影响，从而有明确功能影响的snp，比如cyp2c19的*2、*3多态性的snp可以降低相应酶活性造成慢代谢。

由于基因组上snp数量巨大，在做基因扫描确定与疾病关系研究时成本巨大，但遗传时距离近的基因往往形成连锁，snp也成片的传递，既距离越近的snp一起传递给下一代的机率越高而形成连锁，一段片段内一个snp往往可以代表区域内所有snp的类型，那这个snp就称tag-snp，既标签snp，运用标签snp可大幅减少研究时所要检测的snp数量，降低研究成本。