从头测序组装完毕后为什么要建BAC文库检测

问题描述

精选答案

现在的主流测序仪的读长read都比较短，这就造成我们所得到的序列无法确定在基因组的位置，我们获得的只是一段一段的contig(基于read的交叠overlap所拼接的序列）。

BAC文库第一可以帮助我们拼接更长的序列。另外由于文库构建存在一定的偏好性（有一些序列文库构建率低），或者有一些序列GC含量太高或太低，当然还有一些repeat序列，所以BAC文库也可以帮助我们对这些序列更好的获得。现在主流的方法是构建mate-pair文库+多插入片段PE文库+多测序平台结合+fish或者binano光学图谱 来构建新物种的denovo测序。