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基因组测序中,什么是测序深度和覆盖度

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问题更新日期:2024-11-07 00:14:16

问题描述

基因组测序中,什么是测序深度和覆盖度,麻烦给回复
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测序深度是指测序数据对基因组覆盖深度,如人类基因组有3G,我们测了过滤得到clean data 90G数据量,那么测序深度是90/3=30x,覆盖度是,90G数据比对到人类参考基因组上,可以覆盖基因组的比例,如覆盖度80%